שיוך סיסטמטי

המיקרואורגניזמים הם יצורים (אורגניזמים) זעירים מאוד מקבוצות סיסטמטיות שונות:

מיקרואורגניזמים כוללים את: -הנגיפים (וירוסים) -החיידקים -החד-תאיים -השמרים

אצות חד-תאיות דוגמאות לאצות מיקרוסקופיות: כלמידומנס, כדורון, פנדורינה. קבוצת הפיטופלנקטון(פלנקטון צמחי)

ישנן אצות חד תאיות המתקיימות לבד, וישנן אצות חד תאיות החיות בסימביוזה עם אורגניזמים אחרים.

חיידקים (בקטריות) כל החיידקים הם תאים פרוקריוטים (תא כמעט חסר אברונים, וחסר גרעין) קבוצת החיידקים מתחלקת לשתי קבוצות: חיידקים קדומים (ארכיאה), וחיידקים "רגילים", "אמיתיים". לחיידקים האמיתיים יש דופן הבנוי בעיקר מרב סוכר הנקרא פפטידוגליקן. צורת התא מתחלקת ל 3 סוגים: ~ נקד- תא כדורי, בקוטר של כ 1 מיקרומטר. יכול לבוא בזוג, שרשרת או צבר. ~ מתג- תא גלילי מאורך, עד אורך 3 מיקרומטר. יכול לבוא בזוג או שרשרת. ~ סליל- אורך עד 8-10 מיקרומטר. בודדים בלבד. לפעמים ישנן תוספות מבניות לחיידקים: קופסית, ריסים, ושוטונים. ניתן להבדיל בין החיידקים ע"י בחינת תכונות המושבה.